Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHOP08100 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHOP08100 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHOP08100 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHOP08100 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHOP08100 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOP08100 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOP08100 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOP08100 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOP08100 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOP08100 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOP08100 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOP08100 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOP08100 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOP08100 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOP08100 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOP08100 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOP08100 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOP08100 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOP08100 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOP08100 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOP08100 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOP08100 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOP08100 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms