Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPINO95295 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms