Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3JO75822 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms