Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E2F6O75461 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F6O75461 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F6O75461 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F6O75461 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F6O75461 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F6O75461 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F6O75461 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F6O75461 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F6O75461 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F6O75461 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F6O75461 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F6O75461 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F6O75461 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F6O75461 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F6O75461 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F6O75461 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F6O75461 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
E2F6O75461 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F6O75461 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F6O75461 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F6O75461 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F6O75461 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F6O75461 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F6O75461 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F6O75461 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F6O75461 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F6O75461 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F6O75461 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F6O75461 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F6O75461 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F6O75461 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F6O75461 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F6O75461 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F6O75461 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F6O75461 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F6O75461 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
E2F6O75461 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
E2F6O75461 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F6O75461 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F6O75461 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F6O75461 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F6O75461 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F6O75461 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F6O75461 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F6O75461 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F6O75461 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F6O75461 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F6O75461 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F6O75461 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
E2F6O75461 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F6O75461 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F6O75461 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F6O75461 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F6O75461 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F6O75461 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F6O75461 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F6O75461 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F6O75461 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F6O75461 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F6O75461 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F6O75461 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F6O75461 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F6O75461 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F6O75461 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F6O75461 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
E2F6O75461 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms