Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND1O60716 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND1O60716 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms