Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KIAA0556O60303 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
KIAA0556O60303 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms