Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB3O43889 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB3O43889 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB3O43889 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB3O43889 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB3O43889 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB3O43889 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB3O43889 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB3O43889 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB3O43889 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB3O43889 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB3O43889 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CREB3O43889 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CREB3O43889 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CREB3O43889 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB3O43889 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB3O43889 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB3O43889 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB3O43889 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB3O43889 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB3O43889 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB3O43889 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB3O43889 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB3O43889 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB3O43889 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB3O43889 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB3O43889 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB3O43889 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB3O43889 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB3O43889 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB3O43889 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB3O43889 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB3O43889 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB3O43889 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB3O43889 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB3O43889 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB3O43889 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB3O43889 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB3O43889 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB3O43889 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB3O43889 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB3O43889 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB3O43889 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB3O43889 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB3O43889 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB3O43889 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB3O43889 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB3O43889 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB3O43889 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB3O43889 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB3O43889 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB3O43889 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB3O43889 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB3O43889 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB3O43889 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB3O43889 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB3O43889 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB3O43889 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB3O43889 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB3O43889 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB3O43889 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB3O43889 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB3O43889 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB3O43889 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB3O43889 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB3O43889 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB3O43889 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB3O43889 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB3O43889 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB3O43889 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB3O43889 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB3O43889 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CREB3O43889 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms