Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNQ2O43526 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNQ2O43526 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms