Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRPF3O43395 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF3O43395 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms