Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFKBIEO00221 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKBIEO00221 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKBIEO00221 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKBIEO00221 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKBIEO00221 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKBIEO00221 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKBIEO00221 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKBIEO00221 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKBIEO00221 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKBIEO00221 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKBIEO00221 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKBIEO00221 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKBIEO00221 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKBIEO00221 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKBIEO00221 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKBIEO00221 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms