Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HACD1B0YJ81 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms