Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
C9orf92A6NGG3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms