Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF22A3QJZ6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms