Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6N2

TRBV20-1, T-cell receptor beta variable 20-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20-1A0A075B6N2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRBV20-1A0A075B6N2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRBV20-1A0A075B6N2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRBV20-1A0A075B6N2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TRBV20-1A0A075B6N2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TRBV20-1A0A075B6N2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TRBV20-1A0A075B6N2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TRBV20-1A0A075B6N2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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TRBV20-1A0A075B6N2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRBV20-1A0A075B6N2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV20-1A0A075B6N2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV20-1A0A075B6N2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV20-1A0A075B6N2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV20-1A0A075B6N2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV20-1A0A075B6N2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV20-1A0A075B6N2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV20-1A0A075B6N2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV20-1A0A075B6N2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV20-1A0A075B6N2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV20-1A0A075B6N2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV20-1A0A075B6N2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV20-1A0A075B6N2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV20-1A0A075B6N2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV20-1A0A075B6N2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRBV20-1A0A075B6N2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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