Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdpk1Q9Z2A0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdpk1Q9Z2A0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdpk1Q9Z2A0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdpk1Q9Z2A0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdpk1Q9Z2A0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdpk1Q9Z2A0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdpk1Q9Z2A0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdpk1Q9Z2A0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdpk1Q9Z2A0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdpk1Q9Z2A0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdpk1Q9Z2A0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdpk1Q9Z2A0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdpk1Q9Z2A0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdpk1Q9Z2A0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdpk1Q9Z2A0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdpk1Q9Z2A0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdpk1Q9Z2A0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdpk1Q9Z2A0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdpk1Q9Z2A0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdpk1Q9Z2A0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdpk1Q9Z2A0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdpk1Q9Z2A0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdpk1Q9Z2A0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdpk1Q9Z2A0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdpk1Q9Z2A0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdpk1Q9Z2A0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdpk1Q9Z2A0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdpk1Q9Z2A0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdpk1Q9Z2A0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdpk1Q9Z2A0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdpk1Q9Z2A0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdpk1Q9Z2A0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdpk1Q9Z2A0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdpk1Q9Z2A0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdpk1Q9Z2A0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdpk1Q9Z2A0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdpk1Q9Z2A0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdpk1Q9Z2A0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdpk1Q9Z2A0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdpk1Q9Z2A0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdpk1Q9Z2A0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdpk1Q9Z2A0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdpk1Q9Z2A0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdpk1Q9Z2A0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdpk1Q9Z2A0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdpk1Q9Z2A0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdpk1Q9Z2A0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdpk1Q9Z2A0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdpk1Q9Z2A0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdpk1Q9Z2A0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdpk1Q9Z2A0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdpk1Q9Z2A0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdpk1Q9Z2A0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdpk1Q9Z2A0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdpk1Q9Z2A0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdpk1Q9Z2A0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdpk1Q9Z2A0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdpk1Q9Z2A0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdpk1Q9Z2A0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdpk1Q9Z2A0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdpk1Q9Z2A0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdpk1Q9Z2A0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdpk1Q9Z2A0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdpk1Q9Z2A0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdpk1Q9Z2A0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdpk1Q9Z2A0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms