Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NUDCQ9Y266 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
NUDCQ9Y266 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
NUDCQ9Y266 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NUDCQ9Y266 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NUDCQ9Y266 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NUDCQ9Y266 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NUDCQ9Y266 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NUDCQ9Y266 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NUDCQ9Y266 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NUDCQ9Y266 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NUDCQ9Y266 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NUDCQ9Y266 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NUDCQ9Y266 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NUDCQ9Y266 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NUDCQ9Y266 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NUDCQ9Y266 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NUDCQ9Y266 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NUDCQ9Y266 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NUDCQ9Y266 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NUDCQ9Y266 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUDCQ9Y266 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUDCQ9Y266 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUDCQ9Y266 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUDCQ9Y266 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NUDCQ9Y266 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NUDCQ9Y266 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
NUDCQ9Y266 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUDCQ9Y266 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUDCQ9Y266 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
NUDCQ9Y266 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
NUDCQ9Y266 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
NUDCQ9Y266 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUDCQ9Y266 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUDCQ9Y266 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
NUDCQ9Y266 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
NUDCQ9Y266 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUDCQ9Y266 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUDCQ9Y266 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUDCQ9Y266 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUDCQ9Y266 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUDCQ9Y266 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NUDCQ9Y266 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NUDCQ9Y266 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NUDCQ9Y266 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NUDCQ9Y266 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NUDCQ9Y266 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NUDCQ9Y266 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NUDCQ9Y266 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NUDCQ9Y266 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NUDCQ9Y266 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NUDCQ9Y266 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms