Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMG5Q9UPR3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMG5Q9UPR3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMG5Q9UPR3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMG5Q9UPR3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMG5Q9UPR3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMG5Q9UPR3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMG5Q9UPR3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMG5Q9UPR3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMG5Q9UPR3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMG5Q9UPR3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMG5Q9UPR3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMG5Q9UPR3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMG5Q9UPR3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMG5Q9UPR3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMG5Q9UPR3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMG5Q9UPR3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMG5Q9UPR3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMG5Q9UPR3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMG5Q9UPR3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMG5Q9UPR3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMG5Q9UPR3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMG5Q9UPR3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SMG5Q9UPR3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMG5Q9UPR3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMG5Q9UPR3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMG5Q9UPR3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMG5Q9UPR3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMG5Q9UPR3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms