Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ChmQ9QXG2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ChmQ9QXG2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ChmQ9QXG2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ChmQ9QXG2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ChmQ9QXG2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ChmQ9QXG2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ChmQ9QXG2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ChmQ9QXG2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ChmQ9QXG2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ChmQ9QXG2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ChmQ9QXG2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ChmQ9QXG2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ChmQ9QXG2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ChmQ9QXG2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ChmQ9QXG2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ChmQ9QXG2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ChmQ9QXG2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ChmQ9QXG2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ChmQ9QXG2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ChmQ9QXG2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ChmQ9QXG2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChmQ9QXG2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChmQ9QXG2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChmQ9QXG2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChmQ9QXG2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChmQ9QXG2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChmQ9QXG2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ChmQ9QXG2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ChmQ9QXG2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ChmQ9QXG2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms