Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msh5Q9QUM7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Msh5Q9QUM7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Msh5Q9QUM7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Msh5Q9QUM7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Msh5Q9QUM7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Msh5Q9QUM7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Msh5Q9QUM7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Msh5Q9QUM7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Msh5Q9QUM7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Msh5Q9QUM7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh5Q9QUM7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh5Q9QUM7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh5Q9QUM7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh5Q9QUM7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Msh5Q9QUM7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msh5Q9QUM7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msh5Q9QUM7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Msh5Q9QUM7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msh5Q9QUM7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msh5Q9QUM7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msh5Q9QUM7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msh5Q9QUM7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Msh5Q9QUM7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msh5Q9QUM7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Msh5Q9QUM7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msh5Q9QUM7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msh5Q9QUM7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Msh5Q9QUM7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msh5Q9QUM7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Msh5Q9QUM7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Msh5Q9QUM7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msh5Q9QUM7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msh5Q9QUM7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msh5Q9QUM7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Msh5Q9QUM7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msh5Q9QUM7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msh5Q9QUM7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msh5Q9QUM7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msh5Q9QUM7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Msh5Q9QUM7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msh5Q9QUM7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msh5Q9QUM7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Msh5Q9QUM7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msh5Q9QUM7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Msh5Q9QUM7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msh5Q9QUM7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Msh5Q9QUM7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msh5Q9QUM7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Msh5Q9QUM7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msh5Q9QUM7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Msh5Q9QUM7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Msh5Q9QUM7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Msh5Q9QUM7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms