Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.367e-10■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 SPATS2-213ENST00000549375 1061 ntTSL 212.63□□□□□ -0.398e-9■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.487e-10■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 SPATS2-207ENST00000548710 558 ntTSL 411.71□□□□□ -0.538e-9■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 NUP54-202ENST00000502850 1604 ntTSL 1 (best)10.99□□□□□ -0.657e-10■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 NUP54-203ENST00000504173 314 ntTSL 39.24□□□□□ -0.937e-10■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 NUP54-210ENST00000510884 441 ntTSL 39.04□□□□□ -0.967e-10■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 NUP54-211ENST00000512151 1385 ntTSL 28.76□□□□□ -1.017e-10■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 NUP54-207ENST00000508583 521 ntTSL 58.51□□□□□ -1.057e-10■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 NUP54-218ENST00000515460 849 ntTSL 37.13□□□□□ -1.277e-10■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 SPATS2-204ENST00000548377 552 ntTSL 47.13□□□□□ -1.278e-9■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.278e-9■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 NUP54-204ENST00000506098 548 ntTSL 46.54□□□□□ -1.367e-10■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 SPATS2-206ENST00000548654 546 ntTSL 35.59□□□□□ -1.518e-9■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 SPATS2-215ENST00000549538 570 ntTSL 45.22□□□□□ -1.578e-9■■■■■ 34.7
CSTF2TQ9H0L4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.416e-7■■■■■ 34.6
CSTF2TQ9H0L4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.217e-7■■■■■ 34.6
CSTF2TQ9H0L4 LINC00106-201ENST00000430235 370 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.573e-10■■■■■ 34.6
CSTF2TQ9H0L4 SDCCAG8-202ENST00000435549 1551 ntTSL 1 (best)12.93□□□□□ -0.345e-8■■■■■ 34.6
CSTF2TQ9H0L4 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.555e-8■■■■■ 34.6
CSTF2TQ9H0L4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.234e-7■■■■■ 34.6
CSTF2TQ9H0L4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 34.6
CSTF2TQ9H0L4 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)12.85□□□□□ -0.354e-7■■■■■ 34.6
CSTF2TQ9H0L4 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.364e-7■■■■■ 34.6
CSTF2TQ9H0L4 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 34.6
CSTF2TQ9H0L4 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.614e-8■■■■■ 34.6
CSTF2TQ9H0L4 AC087482.1-202ENST00000558071 903 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.866e-22■■■■■ 34.6
CSTF2TQ9H0L4 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.436e-7■■■■■ 34.5
CSTF2TQ9H0L4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.036e-7■■■■■ 34.5
CSTF2TQ9H0L4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.016e-7■■■■■ 34.5
CSTF2TQ9H0L4 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.426e-7■■■■■ 34.5
CSTF2TQ9H0L4 LINC02365-203ENST00000522554 802 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.259e-10■■■■■ 34.4
CSTF2TQ9H0L4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.276e-20■■■■■ 34.4
CSTF2TQ9H0L4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.216e-20■■■■■ 34.4
CSTF2TQ9H0L4 DAPK1-206ENST00000469067 2499 ntTSL 215.17■□□□□ 0.026e-20■■■■■ 34.4
CSTF2TQ9H0L4 DAPK1-217ENST00000496522 579 ntTSL 214.75□□□□□ -0.056e-20■■■■■ 34.4
CSTF2TQ9H0L4 DAPK1-210ENST00000472344 548 ntTSL 513.6□□□□□ -0.236e-20■■■■■ 34.4
CSTF2TQ9H0L4 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.496e-20■■■■■ 34.4
CSTF2TQ9H0L4 DAPK1-219ENST00000622514 5772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.596e-20■■■■■ 34.4
CSTF2TQ9H0L4 DAPK1-213ENST00000491893 4186 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.636e-20■■■■■ 34.4
CSTF2TQ9H0L4 DAPK1-209ENST00000472284 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.686e-20■■■■■ 34.4
CSTF2TQ9H0L4 DAPK1-212ENST00000489291 4334 ntTSL 1 (best)8.8□□□□□ -16e-20■■■■■ 34.4
CSTF2TQ9H0L4 LINC00923-204ENST00000614972 1181 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.318e-9■■■■■ 34.4
CSTF2TQ9H0L4 SLC25A29-214ENST00000556201 563 ntTSL 416.29■□□□□ 0.21e-9■■■■■ 34.3
CSTF2TQ9H0L4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 34.2
CSTF2TQ9H0L4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.492e-10■■■■■ 34.2
CSTF2TQ9H0L4 TMEM91-214ENST00000604123 757 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.72e-10■■■■■ 34.2
CSTF2TQ9H0L4 TMEM91-204ENST00000413014 650 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.732e-10■■■■■ 34.2
CSTF2TQ9H0L4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.532e-9■■■■■ 34.1
CSTF2TQ9H0L4 KCTD15-210ENST00000590906 534 ntTSL 411.49□□□□□ -0.572e-9■■■■■ 34.1
CSTF2TQ9H0L4 AKT1-205ENST00000553506 2830 ntTSL 217.62■□□□□ 0.412e-9■■■■■ 34.1
CSTF2TQ9H0L4 AKT1-210ENST00000554826 572 ntTSL 313.13□□□□□ -0.312e-9■■■■■ 34.1
CSTF2TQ9H0L4 CDK17-211ENST00000552496 583 ntTSL 37.55□□□□□ -1.23e-10■■■■■ 34
CSTF2TQ9H0L4 CDK17-209ENST00000551816 626 ntTSL 45.38□□□□□ -1.553e-10■■■■■ 34
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-201ENST00000352800 611 ntTSL 519.86■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 33.9
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-204ENST00000422442 564 ntTSL 517.81■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 33.9
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-203ENST00000422066 604 ntTSL 416.79■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 33.9
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-209ENST00000431421 550 ntTSL 416.79■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 33.9
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-225ENST00000636187 171 ntTSL 516.5■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 33.9
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-219ENST00000627825 312 ntTSL 516.29■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 33.9
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-217ENST00000626672 568 ntTSL 415.63■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 33.9
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CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-202ENST00000413084 592 ntTSL 415.5■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 33.9
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-210ENST00000431674 559 ntTSL 414.99□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 33.9
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-213ENST00000450267 588 ntTSL 314.53□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 33.9
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-214ENST00000457928 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.811e-7■■■■■ 33.9
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-224ENST00000635794 768 ntTSL 57.99□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 33.9
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-221ENST00000630833 567 ntTSL 44.43□□□□□ -1.71e-7■■■■■ 33.9
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-232ENST00000637544 214 ntTSL 52.63□□□□□ -1.991e-7■■■■■ 33.9
CSTF2TQ9H0L4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.551e-9■■■■■ 33.9
CSTF2TQ9H0L4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.211e-9■■■■■ 33.9
CSTF2TQ9H0L4 FBXL17-206ENST00000619412 4059 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.111e-9■■■■■ 33.9
CSTF2TQ9H0L4 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.281e-9■■■■■ 33.9
CSTF2TQ9H0L4 FBXL17-202ENST00000481160 604 ntTSL 36.06□□□□□ -1.441e-9■■■■■ 33.9
CSTF2TQ9H0L4 CSNK1D-218ENST00000581655 549 ntTSL 412.08□□□□□ -0.486e-10■■■■■ 33.9
CSTF2TQ9H0L4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.029e-17■■■■■ 33.8
CSTF2TQ9H0L4 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.229e-17■■■■■ 33.8
CSTF2TQ9H0L4 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.439e-17■■■■■ 33.8
CSTF2TQ9H0L4 COG5-208ENST00000475638 592 ntTSL 36.58□□□□□ -1.369e-17■■■■■ 33.8
CSTF2TQ9H0L4 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.452e-10■■■■■ 33.8
CSTF2TQ9H0L4 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 33.8
CSTF2TQ9H0L4 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.491e-8■■■■■ 33.8
CSTF2TQ9H0L4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.781e-9■■■■■ 33.7
CSTF2TQ9H0L4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.291e-9■■■■■ 33.7
CSTF2TQ9H0L4 NAP1L1-222ENST00000551992 1074 ntTSL 522.61■■□□□ 1.218e-12■■■■■ 33.7
CSTF2TQ9H0L4 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-9■■■■■ 33.7
CSTF2TQ9H0L4 ICA1-217ENST00000486677 322 ntTSL 520.71■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 33.7
CSTF2TQ9H0L4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 33.7
CSTF2TQ9H0L4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 33.7
CSTF2TQ9H0L4 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 33.7
CSTF2TQ9H0L4 ICA1-204ENST00000396675 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 33.7
CSTF2TQ9H0L4 ICA1-213ENST00000455539 1956 ntTSL 1 (best)10.92□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 33.7
CSTF2TQ9H0L4 ICA1-215ENST00000470696 800 ntTSL 510.63□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 33.7
CSTF2TQ9H0L4 ICA1-209ENST00000422063 1539 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 33.7
CSTF2TQ9H0L4 ICA1-205ENST00000401396 1742 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 33.7
CSTF2TQ9H0L4 ICA1-203ENST00000339809 1415 ntTSL 1 (best)6.33□□□□□ -1.42e-6■■■■■ 33.7
CSTF2TQ9H0L4 CDK6-204ENST00000473078 386 ntTSL 22.65□□□□□ -1.994e-7■■■■■ 33.6
CSTF2TQ9H0L4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.764e-11■■■■■ 33.6
CSTF2TQ9H0L4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.124e-11■■■■■ 33.6
CSTF2TQ9H0L4 TBKBP1-202ENST00000537587 705 ntTSL 312.47□□□□□ -0.414e-9■■■■■ 33.6
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