Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D727 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D727 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D727 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D727 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D727 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D727 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D727 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D727 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D727 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D727 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D727 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D727 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D727 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9D727 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D727 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D727 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D727 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D727 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D727 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D727 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D727 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D727 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D727 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D727 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D727 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D727 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D727 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D727 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D727 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D727 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D727 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D727 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D727 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D727 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D727 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D727 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D727 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D727 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D727 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D727 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D727 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D727 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D727 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D727 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D727 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D727 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D727 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D727 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D727 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D727 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D727 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D727 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D727 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D727 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D727 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D727 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D727 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D727 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D727 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D727 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D727 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D727 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D727 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D727 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D727 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D727 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D727 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D727 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D727 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D727 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D727 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D727 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D727 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D727 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D727 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D727 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D727 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D727 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D727 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D727 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D727 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D727 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D727 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D727 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D727 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D727 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D727 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D727 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D727 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D727 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D727 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D727 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D727 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D727 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D727 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D727 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D727 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D727 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D727 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms