Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5F6

4930447A16Rik, RIKEN cDNA 4930447A16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447A16RikQ9D5F6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930447A16RikQ9D5F6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930447A16RikQ9D5F6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930447A16RikQ9D5F6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930447A16RikQ9D5F6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930447A16RikQ9D5F6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
4930447A16RikQ9D5F6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930447A16RikQ9D5F6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930447A16RikQ9D5F6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930447A16RikQ9D5F6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930447A16RikQ9D5F6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
4930447A16RikQ9D5F6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930447A16RikQ9D5F6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930447A16RikQ9D5F6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930447A16RikQ9D5F6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930447A16RikQ9D5F6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4930447A16RikQ9D5F6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930447A16RikQ9D5F6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930447A16RikQ9D5F6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4930447A16RikQ9D5F6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930447A16RikQ9D5F6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
4930447A16RikQ9D5F6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4930447A16RikQ9D5F6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
4930447A16RikQ9D5F6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930447A16RikQ9D5F6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930447A16RikQ9D5F6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930447A16RikQ9D5F6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930447A16RikQ9D5F6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4930447A16RikQ9D5F6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930447A16RikQ9D5F6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930447A16RikQ9D5F6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
4930447A16RikQ9D5F6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930447A16RikQ9D5F6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930447A16RikQ9D5F6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930447A16RikQ9D5F6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930447A16RikQ9D5F6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930447A16RikQ9D5F6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
4930447A16RikQ9D5F6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
4930447A16RikQ9D5F6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930447A16RikQ9D5F6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
4930447A16RikQ9D5F6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930447A16RikQ9D5F6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930447A16RikQ9D5F6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
4930447A16RikQ9D5F6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
4930447A16RikQ9D5F6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms