Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp6v1e2Q9D593 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp6v1e2Q9D593 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp6v1e2Q9D593 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp6v1e2Q9D593 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp6v1e2Q9D593 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp6v1e2Q9D593 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp6v1e2Q9D593 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp6v1e2Q9D593 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp6v1e2Q9D593 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp6v1e2Q9D593 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp6v1e2Q9D593 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp6v1e2Q9D593 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp6v1e2Q9D593 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp6v1e2Q9D593 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp6v1e2Q9D593 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp6v1e2Q9D593 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp6v1e2Q9D593 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp6v1e2Q9D593 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp6v1e2Q9D593 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp6v1e2Q9D593 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp6v1e2Q9D593 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp6v1e2Q9D593 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp6v1e2Q9D593 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp6v1e2Q9D593 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp6v1e2Q9D593 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp6v1e2Q9D593 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp6v1e2Q9D593 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp6v1e2Q9D593 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp6v1e2Q9D593 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp6v1e2Q9D593 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atp6v1e2Q9D593 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp6v1e2Q9D593 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp6v1e2Q9D593 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atp6v1e2Q9D593 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp6v1e2Q9D593 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp6v1e2Q9D593 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atp6v1e2Q9D593 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp6v1e2Q9D593 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp6v1e2Q9D593 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp6v1e2Q9D593 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atp6v1e2Q9D593 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp6v1e2Q9D593 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp6v1e2Q9D593 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp6v1e2Q9D593 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp6v1e2Q9D593 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp6v1e2Q9D593 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atp6v1e2Q9D593 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp6v1e2Q9D593 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atp6v1e2Q9D593 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Atp6v1e2Q9D593 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atp6v1e2Q9D593 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atp6v1e2Q9D593 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp6v1e2Q9D593 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atp6v1e2Q9D593 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp6v1e2Q9D593 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp6v1e2Q9D593 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp6v1e2Q9D593 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Atp6v1e2Q9D593 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp6v1e2Q9D593 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp6v1e2Q9D593 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atp6v1e2Q9D593 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp6v1e2Q9D593 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atp6v1e2Q9D593 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp6v1e2Q9D593 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp6v1e2Q9D593 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp6v1e2Q9D593 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp6v1e2Q9D593 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp6v1e2Q9D593 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp6v1e2Q9D593 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms