Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shisal2bQ9D1Y9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Shisal2bQ9D1Y9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shisal2bQ9D1Y9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisal2bQ9D1Y9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisal2bQ9D1Y9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisal2bQ9D1Y9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisal2bQ9D1Y9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisal2bQ9D1Y9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisal2bQ9D1Y9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisal2bQ9D1Y9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisal2bQ9D1Y9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisal2bQ9D1Y9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisal2bQ9D1Y9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisal2bQ9D1Y9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisal2bQ9D1Y9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisal2bQ9D1Y9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisal2bQ9D1Y9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisal2bQ9D1Y9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisal2bQ9D1Y9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisal2bQ9D1Y9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisal2bQ9D1Y9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisal2bQ9D1Y9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shisal2bQ9D1Y9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shisal2bQ9D1Y9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisal2bQ9D1Y9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135 ms