Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cxxc1Q9CWW7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cxxc1Q9CWW7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cxxc1Q9CWW7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxxc1Q9CWW7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxxc1Q9CWW7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxxc1Q9CWW7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxxc1Q9CWW7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxxc1Q9CWW7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxxc1Q9CWW7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cxxc1Q9CWW7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cxxc1Q9CWW7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cxxc1Q9CWW7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cxxc1Q9CWW7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cxxc1Q9CWW7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cxxc1Q9CWW7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cxxc1Q9CWW7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cxxc1Q9CWW7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cxxc1Q9CWW7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cxxc1Q9CWW7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cxxc1Q9CWW7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cxxc1Q9CWW7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cxxc1Q9CWW7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cxxc1Q9CWW7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cxxc1Q9CWW7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cxxc1Q9CWW7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cxxc1Q9CWW7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cxxc1Q9CWW7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cxxc1Q9CWW7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cxxc1Q9CWW7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cxxc1Q9CWW7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cxxc1Q9CWW7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cxxc1Q9CWW7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cxxc1Q9CWW7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cxxc1Q9CWW7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cxxc1Q9CWW7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cxxc1Q9CWW7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cxxc1Q9CWW7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cxxc1Q9CWW7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cxxc1Q9CWW7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cxxc1Q9CWW7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cxxc1Q9CWW7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cxxc1Q9CWW7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cxxc1Q9CWW7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cxxc1Q9CWW7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxxc1Q9CWW7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxxc1Q9CWW7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxxc1Q9CWW7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxxc1Q9CWW7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxxc1Q9CWW7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxxc1Q9CWW7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cxxc1Q9CWW7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cxxc1Q9CWW7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxxc1Q9CWW7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxxc1Q9CWW7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxxc1Q9CWW7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cxxc1Q9CWW7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cxxc1Q9CWW7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cxxc1Q9CWW7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cxxc1Q9CWW7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cxxc1Q9CWW7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cxxc1Q9CWW7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cxxc1Q9CWW7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cxxc1Q9CWW7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cxxc1Q9CWW7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cxxc1Q9CWW7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cxxc1Q9CWW7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cxxc1Q9CWW7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cxxc1Q9CWW7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cxxc1Q9CWW7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cxxc1Q9CWW7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cxxc1Q9CWW7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cxxc1Q9CWW7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cxxc1Q9CWW7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cxxc1Q9CWW7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cxxc1Q9CWW7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cxxc1Q9CWW7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cxxc1Q9CWW7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cxxc1Q9CWW7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cxxc1Q9CWW7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cxxc1Q9CWW7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cxxc1Q9CWW7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cxxc1Q9CWW7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cxxc1Q9CWW7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cxxc1Q9CWW7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cxxc1Q9CWW7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cxxc1Q9CWW7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cxxc1Q9CWW7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cxxc1Q9CWW7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cxxc1Q9CWW7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cxxc1Q9CWW7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cxxc1Q9CWW7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms