Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atad3Q925I1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atad3Q925I1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atad3Q925I1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atad3Q925I1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atad3Q925I1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atad3Q925I1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atad3Q925I1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atad3Q925I1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atad3Q925I1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atad3Q925I1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atad3Q925I1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atad3Q925I1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atad3Q925I1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atad3Q925I1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atad3Q925I1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atad3Q925I1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atad3Q925I1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atad3Q925I1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atad3Q925I1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atad3Q925I1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atad3Q925I1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atad3Q925I1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atad3Q925I1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atad3Q925I1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atad3Q925I1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atad3Q925I1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atad3Q925I1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atad3Q925I1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atad3Q925I1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atad3Q925I1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atad3Q925I1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atad3Q925I1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atad3Q925I1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atad3Q925I1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atad3Q925I1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atad3Q925I1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atad3Q925I1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atad3Q925I1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atad3Q925I1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atad3Q925I1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms