Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4F0

Mcoln3, Mucolipin-3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln3Q8R4F0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcoln3Q8R4F0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcoln3Q8R4F0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcoln3Q8R4F0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mcoln3Q8R4F0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcoln3Q8R4F0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mcoln3Q8R4F0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mcoln3Q8R4F0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcoln3Q8R4F0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mcoln3Q8R4F0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcoln3Q8R4F0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mcoln3Q8R4F0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcoln3Q8R4F0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcoln3Q8R4F0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mcoln3Q8R4F0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcoln3Q8R4F0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcoln3Q8R4F0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mcoln3Q8R4F0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcoln3Q8R4F0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcoln3Q8R4F0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mcoln3Q8R4F0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mcoln3Q8R4F0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mcoln3Q8R4F0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mcoln3Q8R4F0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcoln3Q8R4F0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mcoln3Q8R4F0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcoln3Q8R4F0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcoln3Q8R4F0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcoln3Q8R4F0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcoln3Q8R4F0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcoln3Q8R4F0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mcoln3Q8R4F0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mcoln3Q8R4F0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mcoln3Q8R4F0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mcoln3Q8R4F0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mcoln3Q8R4F0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mcoln3Q8R4F0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mcoln3Q8R4F0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mcoln3Q8R4F0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcoln3Q8R4F0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcoln3Q8R4F0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mcoln3Q8R4F0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mcoln3Q8R4F0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mcoln3Q8R4F0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mcoln3Q8R4F0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcoln3Q8R4F0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcoln3Q8R4F0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcoln3Q8R4F0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcoln3Q8R4F0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mcoln3Q8R4F0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcoln3Q8R4F0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mcoln3Q8R4F0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mcoln3Q8R4F0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms