Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Treml1Q8K558 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Treml1Q8K558 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Treml1Q8K558 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Treml1Q8K558 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Treml1Q8K558 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Treml1Q8K558 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Treml1Q8K558 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Treml1Q8K558 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Treml1Q8K558 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Treml1Q8K558 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Treml1Q8K558 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Treml1Q8K558 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Treml1Q8K558 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Treml1Q8K558 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Treml1Q8K558 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Treml1Q8K558 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Treml1Q8K558 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Treml1Q8K558 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Treml1Q8K558 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Treml1Q8K558 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Treml1Q8K558 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Treml1Q8K558 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Treml1Q8K558 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Treml1Q8K558 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Treml1Q8K558 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Treml1Q8K558 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Treml1Q8K558 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Treml1Q8K558 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Treml1Q8K558 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Treml1Q8K558 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Treml1Q8K558 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Treml1Q8K558 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Treml1Q8K558 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Treml1Q8K558 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Treml1Q8K558 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Treml1Q8K558 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Treml1Q8K558 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Treml1Q8K558 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Treml1Q8K558 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Treml1Q8K558 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Treml1Q8K558 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Treml1Q8K558 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Treml1Q8K558 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Treml1Q8K558 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Treml1Q8K558 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Treml1Q8K558 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Treml1Q8K558 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Treml1Q8K558 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Treml1Q8K558 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Treml1Q8K558 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Treml1Q8K558 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Treml1Q8K558 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Treml1Q8K558 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Treml1Q8K558 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Treml1Q8K558 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Treml1Q8K558 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.3 ms