Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7I4

Apol9b, Apolipoprotein L 9b, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9bQ8C7I4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apol9bQ8C7I4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apol9bQ8C7I4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol9bQ8C7I4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol9bQ8C7I4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol9bQ8C7I4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol9bQ8C7I4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apol9bQ8C7I4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apol9bQ8C7I4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apol9bQ8C7I4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apol9bQ8C7I4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apol9bQ8C7I4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apol9bQ8C7I4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apol9bQ8C7I4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol9bQ8C7I4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol9bQ8C7I4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol9bQ8C7I4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol9bQ8C7I4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apol9bQ8C7I4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apol9bQ8C7I4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apol9bQ8C7I4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apol9bQ8C7I4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apol9bQ8C7I4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apol9bQ8C7I4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apol9bQ8C7I4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apol9bQ8C7I4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apol9bQ8C7I4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apol9bQ8C7I4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apol9bQ8C7I4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apol9bQ8C7I4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apol9bQ8C7I4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Apol9bQ8C7I4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apol9bQ8C7I4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Apol9bQ8C7I4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apol9bQ8C7I4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apol9bQ8C7I4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apol9bQ8C7I4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apol9bQ8C7I4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apol9bQ8C7I4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apol9bQ8C7I4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apol9bQ8C7I4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Apol9bQ8C7I4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apol9bQ8C7I4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apol9bQ8C7I4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apol9bQ8C7I4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apol9bQ8C7I4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apol9bQ8C7I4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apol9bQ8C7I4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Apol9bQ8C7I4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apol9bQ8C7I4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apol9bQ8C7I4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Apol9bQ8C7I4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apol9bQ8C7I4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apol9bQ8C7I4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms