Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg16l1Q8C0J2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg16l1Q8C0J2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg16l1Q8C0J2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg16l1Q8C0J2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg16l1Q8C0J2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg16l1Q8C0J2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg16l1Q8C0J2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg16l1Q8C0J2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg16l1Q8C0J2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg16l1Q8C0J2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg16l1Q8C0J2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg16l1Q8C0J2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg16l1Q8C0J2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atg16l1Q8C0J2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg16l1Q8C0J2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg16l1Q8C0J2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg16l1Q8C0J2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atg16l1Q8C0J2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg16l1Q8C0J2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg16l1Q8C0J2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg16l1Q8C0J2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg16l1Q8C0J2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg16l1Q8C0J2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg16l1Q8C0J2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg16l1Q8C0J2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg16l1Q8C0J2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg16l1Q8C0J2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg16l1Q8C0J2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg16l1Q8C0J2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg16l1Q8C0J2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg16l1Q8C0J2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg16l1Q8C0J2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg16l1Q8C0J2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg16l1Q8C0J2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg16l1Q8C0J2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg16l1Q8C0J2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg16l1Q8C0J2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg16l1Q8C0J2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms