Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops7bQ8BV13 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops7bQ8BV13 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops7bQ8BV13 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops7bQ8BV13 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops7bQ8BV13 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cops7bQ8BV13 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cops7bQ8BV13 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops7bQ8BV13 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops7bQ8BV13 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cops7bQ8BV13 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops7bQ8BV13 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops7bQ8BV13 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cops7bQ8BV13 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops7bQ8BV13 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops7bQ8BV13 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops7bQ8BV13 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops7bQ8BV13 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cops7bQ8BV13 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops7bQ8BV13 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops7bQ8BV13 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops7bQ8BV13 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops7bQ8BV13 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops7bQ8BV13 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops7bQ8BV13 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops7bQ8BV13 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops7bQ8BV13 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops7bQ8BV13 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops7bQ8BV13 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops7bQ8BV13 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops7bQ8BV13 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops7bQ8BV13 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops7bQ8BV13 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cops7bQ8BV13 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops7bQ8BV13 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops7bQ8BV13 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops7bQ8BV13 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops7bQ8BV13 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops7bQ8BV13 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops7bQ8BV13 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops7bQ8BV13 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops7bQ8BV13 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cops7bQ8BV13 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cops7bQ8BV13 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops7bQ8BV13 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops7bQ8BV13 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops7bQ8BV13 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops7bQ8BV13 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops7bQ8BV13 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms