Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubash3bQ8BGG7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubash3bQ8BGG7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubash3bQ8BGG7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubash3bQ8BGG7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubash3bQ8BGG7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubash3bQ8BGG7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubash3bQ8BGG7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubash3bQ8BGG7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubash3bQ8BGG7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubash3bQ8BGG7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubash3bQ8BGG7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubash3bQ8BGG7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubash3bQ8BGG7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubash3bQ8BGG7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubash3bQ8BGG7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubash3bQ8BGG7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubash3bQ8BGG7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubash3bQ8BGG7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubash3bQ8BGG7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubash3bQ8BGG7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubash3bQ8BGG7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubash3bQ8BGG7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubash3bQ8BGG7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubash3bQ8BGG7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubash3bQ8BGG7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubash3bQ8BGG7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubash3bQ8BGG7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubash3bQ8BGG7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubash3bQ8BGG7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubash3bQ8BGG7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubash3bQ8BGG7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubash3bQ8BGG7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubash3bQ8BGG7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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