Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc50Q810U5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc50Q810U5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc50Q810U5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc50Q810U5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc50Q810U5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc50Q810U5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc50Q810U5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc50Q810U5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc50Q810U5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc50Q810U5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc50Q810U5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc50Q810U5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc50Q810U5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc50Q810U5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc50Q810U5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc50Q810U5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc50Q810U5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc50Q810U5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc50Q810U5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc50Q810U5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc50Q810U5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc50Q810U5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccdc50Q810U5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccdc50Q810U5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc50Q810U5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc50Q810U5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc50Q810U5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc50Q810U5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc50Q810U5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc50Q810U5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc50Q810U5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc50Q810U5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc50Q810U5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc50Q810U5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc50Q810U5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc50Q810U5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc50Q810U5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc50Q810U5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc50Q810U5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc50Q810U5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1587.6 ms