Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cul9Q80TT8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Cul9Q80TT8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cul9Q80TT8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cul9Q80TT8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cul9Q80TT8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Cul9Q80TT8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Cul9Q80TT8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cul9Q80TT8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Cul9Q80TT8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Cul9Q80TT8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Cul9Q80TT8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cul9Q80TT8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cul9Q80TT8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Cul9Q80TT8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cul9Q80TT8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cul9Q80TT8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Cul9Q80TT8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cul9Q80TT8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cul9Q80TT8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cul9Q80TT8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cul9Q80TT8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cul9Q80TT8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cul9Q80TT8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cul9Q80TT8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cul9Q80TT8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cul9Q80TT8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cul9Q80TT8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cul9Q80TT8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cul9Q80TT8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cul9Q80TT8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cul9Q80TT8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cul9Q80TT8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cul9Q80TT8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cul9Q80TT8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Cul9Q80TT8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cul9Q80TT8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cul9Q80TT8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cul9Q80TT8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cul9Q80TT8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cul9Q80TT8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Cul9Q80TT8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cul9Q80TT8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cul9Q80TT8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Cul9Q80TT8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Cul9Q80TT8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Cul9Q80TT8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cul9Q80TT8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cul9Q80TT8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cul9Q80TT8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cul9Q80TT8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cul9Q80TT8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Cul9Q80TT8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cul9Q80TT8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cul9Q80TT8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cul9Q80TT8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Cul9Q80TT8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cul9Q80TT8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cul9Q80TT8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Cul9Q80TT8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cul9Q80TT8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cul9Q80TT8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cul9Q80TT8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Cul9Q80TT8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cul9Q80TT8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cul9Q80TT8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
Cul9Q80TT8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cul9Q80TT8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cul9Q80TT8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cul9Q80TT8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cul9Q80TT8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cul9Q80TT8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cul9Q80TT8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cul9Q80TT8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cul9Q80TT8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cul9Q80TT8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cul9Q80TT8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Cul9Q80TT8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Cul9Q80TT8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cul9Q80TT8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cul9Q80TT8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Cul9Q80TT8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cul9Q80TT8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cul9Q80TT8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cul9Q80TT8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Cul9Q80TT8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cul9Q80TT8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cul9Q80TT8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Cul9Q80TT8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cul9Q80TT8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cul9Q80TT8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Cul9Q80TT8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Cul9Q80TT8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cul9Q80TT8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Cul9Q80TT8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cul9Q80TT8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Cul9Q80TT8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Cul9Q80TT8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cul9Q80TT8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Cul9Q80TT8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms