Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC42.59■■■■■ 4.41
CLASP1Q7Z460 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
CLASP1Q7Z460 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
CLASP1Q7Z460 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CLASP1Q7Z460 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
CLASP1Q7Z460 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
CLASP1Q7Z460 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
CLASP1Q7Z460 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CLASP1Q7Z460 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
CLASP1Q7Z460 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CLASP1Q7Z460 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CLASP1Q7Z460 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CLASP1Q7Z460 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CLASP1Q7Z460 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CLASP1Q7Z460 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CLASP1Q7Z460 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
CLASP1Q7Z460 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
CLASP1Q7Z460 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
CLASP1Q7Z460 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CLASP1Q7Z460 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CLASP1Q7Z460 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CLASP1Q7Z460 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CLASP1Q7Z460 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CLASP1Q7Z460 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CLASP1Q7Z460 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CLASP1Q7Z460 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
CLASP1Q7Z460 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CLASP1Q7Z460 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CLASP1Q7Z460 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
CLASP1Q7Z460 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
CLASP1Q7Z460 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
CLASP1Q7Z460 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC42.41■■■■■ 4.38
CLASP1Q7Z460 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
CLASP1Q7Z460 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
CLASP1Q7Z460 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
CLASP1Q7Z460 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CLASP1Q7Z460 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CLASP1Q7Z460 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CLASP1Q7Z460 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
CLASP1Q7Z460 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
CLASP1Q7Z460 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
CLASP1Q7Z460 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
CLASP1Q7Z460 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
CLASP1Q7Z460 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
CLASP1Q7Z460 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CLASP1Q7Z460 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
CLASP1Q7Z460 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
CLASP1Q7Z460 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
CLASP1Q7Z460 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CLASP1Q7Z460 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
CLASP1Q7Z460 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
CLASP1Q7Z460 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CLASP1Q7Z460 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
CLASP1Q7Z460 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
CLASP1Q7Z460 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CLASP1Q7Z460 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CLASP1Q7Z460 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
CLASP1Q7Z460 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CLASP1Q7Z460 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CLASP1Q7Z460 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CLASP1Q7Z460 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CLASP1Q7Z460 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
CLASP1Q7Z460 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
CLASP1Q7Z460 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CLASP1Q7Z460 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
CLASP1Q7Z460 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CLASP1Q7Z460 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CLASP1Q7Z460 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
CLASP1Q7Z460 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CLASP1Q7Z460 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CLASP1Q7Z460 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC42.25■■■■■ 4.35
CLASP1Q7Z460 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CLASP1Q7Z460 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CLASP1Q7Z460 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CLASP1Q7Z460 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CLASP1Q7Z460 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CLASP1Q7Z460 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
CLASP1Q7Z460 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CLASP1Q7Z460 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CLASP1Q7Z460 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CLASP1Q7Z460 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CLASP1Q7Z460 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CLASP1Q7Z460 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CLASP1Q7Z460 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CLASP1Q7Z460 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
CLASP1Q7Z460 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
CLASP1Q7Z460 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CLASP1Q7Z460 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
CLASP1Q7Z460 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
CLASP1Q7Z460 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CLASP1Q7Z460 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
CLASP1Q7Z460 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
CLASP1Q7Z460 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
CLASP1Q7Z460 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
CLASP1Q7Z460 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
CLASP1Q7Z460 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
CLASP1Q7Z460 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
CLASP1Q7Z460 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
CLASP1Q7Z460 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
CLASP1Q7Z460 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms