Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf18Q7TS55 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfsf18Q7TS55 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf18Q7TS55 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf18Q7TS55 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms