Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnt1Q6ZPR4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Kcnt1Q6ZPR4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnt1Q6ZPR4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnt1Q6ZPR4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnt1Q6ZPR4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnt1Q6ZPR4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnt1Q6ZPR4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnt1Q6ZPR4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnt1Q6ZPR4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnt1Q6ZPR4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnt1Q6ZPR4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnt1Q6ZPR4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnt1Q6ZPR4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnt1Q6ZPR4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnt1Q6ZPR4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnt1Q6ZPR4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnt1Q6ZPR4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnt1Q6ZPR4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnt1Q6ZPR4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnt1Q6ZPR4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnt1Q6ZPR4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcnt1Q6ZPR4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnt1Q6ZPR4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnt1Q6ZPR4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnt1Q6ZPR4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnt1Q6ZPR4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnt1Q6ZPR4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnt1Q6ZPR4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnt1Q6ZPR4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnt1Q6ZPR4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnt1Q6ZPR4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnt1Q6ZPR4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnt1Q6ZPR4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnt1Q6ZPR4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnt1Q6ZPR4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnt1Q6ZPR4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnt1Q6ZPR4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnt1Q6ZPR4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnt1Q6ZPR4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcnt1Q6ZPR4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcnt1Q6ZPR4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcnt1Q6ZPR4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnt1Q6ZPR4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnt1Q6ZPR4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnt1Q6ZPR4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnt1Q6ZPR4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnt1Q6ZPR4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnt1Q6ZPR4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnt1Q6ZPR4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnt1Q6ZPR4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kcnt1Q6ZPR4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Kcnt1Q6ZPR4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kcnt1Q6ZPR4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcnt1Q6ZPR4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcnt1Q6ZPR4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcnt1Q6ZPR4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcnt1Q6ZPR4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcnt1Q6ZPR4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnt1Q6ZPR4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnt1Q6ZPR4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcnt1Q6ZPR4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcnt1Q6ZPR4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcnt1Q6ZPR4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcnt1Q6ZPR4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnt1Q6ZPR4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnt1Q6ZPR4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnt1Q6ZPR4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnt1Q6ZPR4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcnt1Q6ZPR4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcnt1Q6ZPR4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnt1Q6ZPR4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Kcnt1Q6ZPR4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnt1Q6ZPR4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnt1Q6ZPR4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnt1Q6ZPR4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnt1Q6ZPR4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms