Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1L6

ZNF343, Zinc finger protein 343, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF343Q6P1L6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF343Q6P1L6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF343Q6P1L6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF343Q6P1L6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF343Q6P1L6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF343Q6P1L6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF343Q6P1L6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF343Q6P1L6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF343Q6P1L6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF343Q6P1L6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms