Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tpm4Q6IRU2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tpm4Q6IRU2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tpm4Q6IRU2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tpm4Q6IRU2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tpm4Q6IRU2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tpm4Q6IRU2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tpm4Q6IRU2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tpm4Q6IRU2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tpm4Q6IRU2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tpm4Q6IRU2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tpm4Q6IRU2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tpm4Q6IRU2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tpm4Q6IRU2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpm4Q6IRU2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpm4Q6IRU2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpm4Q6IRU2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpm4Q6IRU2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tpm4Q6IRU2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tpm4Q6IRU2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tpm4Q6IRU2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpm4Q6IRU2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpm4Q6IRU2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tpm4Q6IRU2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tpm4Q6IRU2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tpm4Q6IRU2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tpm4Q6IRU2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpm4Q6IRU2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tpm4Q6IRU2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tpm4Q6IRU2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms