Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PnkdQ69ZP3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PnkdQ69ZP3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PnkdQ69ZP3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PnkdQ69ZP3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PnkdQ69ZP3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PnkdQ69ZP3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PnkdQ69ZP3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PnkdQ69ZP3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PnkdQ69ZP3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PnkdQ69ZP3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PnkdQ69ZP3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PnkdQ69ZP3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PnkdQ69ZP3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PnkdQ69ZP3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PnkdQ69ZP3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PnkdQ69ZP3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PnkdQ69ZP3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PnkdQ69ZP3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PnkdQ69ZP3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PnkdQ69ZP3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PnkdQ69ZP3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PnkdQ69ZP3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PnkdQ69ZP3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PnkdQ69ZP3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PnkdQ69ZP3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PnkdQ69ZP3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PnkdQ69ZP3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PnkdQ69ZP3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PnkdQ69ZP3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PnkdQ69ZP3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PnkdQ69ZP3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.2 ms