Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atp2a3Q64518 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2a3Q64518 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2a3Q64518 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2a3Q64518 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atp2a3Q64518 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2a3Q64518 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2a3Q64518 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2a3Q64518 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp2a3Q64518 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2a3Q64518 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2a3Q64518 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp2a3Q64518 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2a3Q64518 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2a3Q64518 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2a3Q64518 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp2a3Q64518 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atp2a3Q64518 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp2a3Q64518 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2a3Q64518 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2a3Q64518 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp2a3Q64518 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2a3Q64518 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2a3Q64518 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2a3Q64518 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2a3Q64518 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2a3Q64518 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp2a3Q64518 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2a3Q64518 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp2a3Q64518 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2a3Q64518 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2a3Q64518 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp2a3Q64518 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2a3Q64518 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp2a3Q64518 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp2a3Q64518 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp2a3Q64518 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2a3Q64518 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms