Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrn1Q61809 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrn1Q61809 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrn1Q61809 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrn1Q61809 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrn1Q61809 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lrrn1Q61809 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Lrrn1Q61809 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Lrrn1Q61809 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lrrn1Q61809 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Lrrn1Q61809 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lrrn1Q61809 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Lrrn1Q61809 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Lrrn1Q61809 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lrrn1Q61809 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Lrrn1Q61809 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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Lrrn1Q61809 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lrrn1Q61809 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Lrrn1Q61809 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
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Lrrn1Q61809 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrrn1Q61809 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lrrn1Q61809 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Lrrn1Q61809 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Lrrn1Q61809 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrn1Q61809 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Lrrn1Q61809 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrn1Q61809 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrn1Q61809 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrn1Q61809 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrn1Q61809 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrn1Q61809 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrn1Q61809 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrn1Q61809 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrn1Q61809 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrn1Q61809 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrn1Q61809 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrn1Q61809 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrn1Q61809 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrn1Q61809 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrn1Q61809 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrn1Q61809 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrn1Q61809 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
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Lrrn1Q61809 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrn1Q61809 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lrrn1Q61809 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lrrn1Q61809 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Lrrn1Q61809 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrn1Q61809 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms