Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pacsin1Q61644 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pacsin1Q61644 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pacsin1Q61644 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pacsin1Q61644 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pacsin1Q61644 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pacsin1Q61644 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pacsin1Q61644 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pacsin1Q61644 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pacsin1Q61644 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pacsin1Q61644 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pacsin1Q61644 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pacsin1Q61644 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pacsin1Q61644 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pacsin1Q61644 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pacsin1Q61644 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pacsin1Q61644 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pacsin1Q61644 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pacsin1Q61644 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pacsin1Q61644 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pacsin1Q61644 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pacsin1Q61644 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pacsin1Q61644 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pacsin1Q61644 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pacsin1Q61644 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pacsin1Q61644 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pacsin1Q61644 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pacsin1Q61644 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pacsin1Q61644 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pacsin1Q61644 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pacsin1Q61644 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pacsin1Q61644 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pacsin1Q61644 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pacsin1Q61644 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pacsin1Q61644 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pacsin1Q61644 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pacsin1Q61644 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pacsin1Q61644 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pacsin1Q61644 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pacsin1Q61644 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pacsin1Q61644 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pacsin1Q61644 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pacsin1Q61644 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pacsin1Q61644 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pacsin1Q61644 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pacsin1Q61644 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pacsin1Q61644 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pacsin1Q61644 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pacsin1Q61644 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pacsin1Q61644 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pacsin1Q61644 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pacsin1Q61644 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pacsin1Q61644 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pacsin1Q61644 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pacsin1Q61644 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pacsin1Q61644 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pacsin1Q61644 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pacsin1Q61644 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pacsin1Q61644 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pacsin1Q61644 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pacsin1Q61644 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pacsin1Q61644 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pacsin1Q61644 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pacsin1Q61644 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pacsin1Q61644 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pacsin1Q61644 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pacsin1Q61644 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pacsin1Q61644 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pacsin1Q61644 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pacsin1Q61644 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pacsin1Q61644 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pacsin1Q61644 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pacsin1Q61644 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pacsin1Q61644 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pacsin1Q61644 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pacsin1Q61644 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pacsin1Q61644 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pacsin1Q61644 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pacsin1Q61644 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pacsin1Q61644 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pacsin1Q61644 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pacsin1Q61644 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pacsin1Q61644 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pacsin1Q61644 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pacsin1Q61644 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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