Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lamb3Q61087 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamb3Q61087 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamb3Q61087 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lamb3Q61087 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lamb3Q61087 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lamb3Q61087 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lamb3Q61087 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamb3Q61087 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lamb3Q61087 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamb3Q61087 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lamb3Q61087 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lamb3Q61087 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamb3Q61087 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamb3Q61087 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamb3Q61087 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamb3Q61087 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lamb3Q61087 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamb3Q61087 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamb3Q61087 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lamb3Q61087 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamb3Q61087 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamb3Q61087 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamb3Q61087 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamb3Q61087 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamb3Q61087 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lamb3Q61087 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lamb3Q61087 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamb3Q61087 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamb3Q61087 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamb3Q61087 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamb3Q61087 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamb3Q61087 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamb3Q61087 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamb3Q61087 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamb3Q61087 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamb3Q61087 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamb3Q61087 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamb3Q61087 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamb3Q61087 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamb3Q61087 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamb3Q61087 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamb3Q61087 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamb3Q61087 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamb3Q61087 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamb3Q61087 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamb3Q61087 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lamb3Q61087 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamb3Q61087 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamb3Q61087 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamb3Q61087 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamb3Q61087 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamb3Q61087 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lamb3Q61087 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamb3Q61087 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamb3Q61087 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamb3Q61087 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamb3Q61087 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lamb3Q61087 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamb3Q61087 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamb3Q61087 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lamb3Q61087 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamb3Q61087 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamb3Q61087 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lamb3Q61087 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamb3Q61087 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamb3Q61087 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lamb3Q61087 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lamb3Q61087 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms