Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mks1Q5SW45 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mks1Q5SW45 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mks1Q5SW45 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mks1Q5SW45 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms