Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sft2d1Q5SSN7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sft2d1Q5SSN7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sft2d1Q5SSN7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sft2d1Q5SSN7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sft2d1Q5SSN7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sft2d1Q5SSN7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sft2d1Q5SSN7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sft2d1Q5SSN7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sft2d1Q5SSN7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sft2d1Q5SSN7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sft2d1Q5SSN7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sft2d1Q5SSN7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sft2d1Q5SSN7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sft2d1Q5SSN7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sft2d1Q5SSN7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms