Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q1T7F1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Q1T7F1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q1T7F1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q1T7F1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q1T7F1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q1T7F1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q1T7F1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q1T7F1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q1T7F1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Q1T7F1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q1T7F1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q1T7F1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q1T7F1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q1T7F1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q1T7F1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q1T7F1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Q1T7F1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Q1T7F1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q1T7F1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q1T7F1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q1T7F1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q1T7F1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q1T7F1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q1T7F1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Q1T7F1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Q1T7F1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Q1T7F1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Q1T7F1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q1T7F1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q1T7F1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q1T7F1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Q1T7F1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q1T7F1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q1T7F1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q1T7F1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q1T7F1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q1T7F1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Q1T7F1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q1T7F1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q1T7F1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q1T7F1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q1T7F1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q1T7F1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q1T7F1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q1T7F1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q1T7F1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Q1T7F1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q1T7F1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q1T7F1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q1T7F1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q1T7F1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q1T7F1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Q1T7F1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Q1T7F1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q1T7F1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q1T7F1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q1T7F1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q1T7F1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q1T7F1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Q1T7F1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q1T7F1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q1T7F1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q1T7F1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Q1T7F1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q1T7F1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q1T7F1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q1T7F1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Q1T7F1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q1T7F1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q1T7F1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q1T7F1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q1T7F1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q1T7F1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Q1T7F1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q1T7F1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q1T7F1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q1T7F1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q1T7F1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Q1T7F1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q1T7F1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Q1T7F1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Q1T7F1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q1T7F1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q1T7F1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q1T7F1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q1T7F1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q1T7F1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q1T7F1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Q1T7F1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q1T7F1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q1T7F1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q1T7F1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q1T7F1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q1T7F1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q1T7F1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q1T7F1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q1T7F1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q1T7F1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q1T7F1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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