Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2V1Q13404 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2V1Q13404 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2V1Q13404 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2V1Q13404 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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