Protein–RNA interactions for Protein: Q12463

TRM11, tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM11Q12463 HXK1YFR053C 1458 nt8.83□□□□□ -1
TRM11Q12463 OLA1YBR025C 1185 nt8.82□□□□□ -1
TRM11Q12463 NUP53YMR153W 1428 nt8.81□□□□□ -1
TRM11Q12463 DPL1YDR294C 1770 nt8.81□□□□□ -1
TRM11Q12463 PDC6YGR087C 1692 nt8.8□□□□□ -1
TRM11Q12463 ATP2YJR121W 1536 nt8.8□□□□□ -1
TRM11Q12463 RPC31YNL151C 756 nt8.78□□□□□ -1
TRM11Q12463 NBA1YOL070C 1506 nt8.77□□□□□ -1.01
TRM11Q12463 KRR1YCL059C 951 nt8.77□□□□□ -1.01
TRM11Q12463 YPT31YER031C 672 nt8.76□□□□□ -1.01
TRM11Q12463 RNA170RNA170 169 nt8.76□□□□□ -1.01
TRM11Q12463 LEU4YNL104C 1860 nt8.74□□□□□ -1.01
TRM11Q12463 ARO7YPR060C 771 nt8.74□□□□□ -1.01
TRM11Q12463 YIL168WYIL168W 384 nt8.73□□□□□ -1.01
TRM11Q12463 YOR072WYOR072W 315 nt8.73□□□□□ -1.01
TRM11Q12463 URA8YJR103W 1737 nt8.73□□□□□ -1.01
TRM11Q12463 GGA2YHR108W 1758 nt8.73□□□□□ -1.01
TRM11Q12463 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.72□□□□□ -1.01
TRM11Q12463 YDR476CYDR476C 675 nt8.7□□□□□ -1.02
TRM11Q12463 THI3YDL080C 1830 nt8.7□□□□□ -1.02
TRM11Q12463 FET5YFL041W 1869 nt8.7□□□□□ -1.02
TRM11Q12463 YIR035CYIR035C 765 nt8.69□□□□□ -1.02
TRM11Q12463 RPR1RPR1 369 nt8.69□□□□□ -1.02
TRM11Q12463 RHO1YPR165W 630 nt8.68□□□□□ -1.02
TRM11Q12463 NPP2YEL016C 1482 nt8.67□□□□□ -1.02
TRM11Q12463 RRT6YGL146C 936 nt8.67□□□□□ -1.02
TRM11Q12463 COS10YNR075W 1125 nt8.67□□□□□ -1.02
TRM11Q12463 MEX67YPL169C 1800 nt8.67□□□□□ -1.02
TRM11Q12463 INH1YDL181W 258 nt8.65□□□□□ -1.02
TRM11Q12463 GPM1YKL152C 744 nt8.64□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 YLR358CYLR358C 564 nt8.64□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 THI73YLR004C 1572 nt8.64□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.63□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.63□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.63□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.63□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.63□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.63□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.63□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.63□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.63□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.63□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.63□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.63□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.63□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.63□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.63□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 PSP2YML017W 1782 nt8.63□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 HAC1YFL031W 717 nt8.61□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 TMS1YDR105C 1422 nt8.61□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.6□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.6□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 YML079WYML079W 606 nt8.6□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 BUB2YMR055C 921 nt8.6□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 YDR467CYDR467C 327 nt8.59□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 PUP3YER094C 618 nt8.59□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 YJR154WYJR154W 1041 nt8.59□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 PMU1YKL128C 888 nt8.59□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 YBL095WYBL095W 813 nt8.59□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 AAC3YBR085W 924 nt8.59□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 BSP1YPR171W 1731 nt8.59□□□□□ -1.03
TRM11Q12463 MIM1YOL026C 342 nt8.58□□□□□ -1.04
TRM11Q12463 SHC1YER096W 1539 nt8.58□□□□□ -1.04
TRM11Q12463 MDL2YPL270W 2322 nt8.58□□□□□ -1.04
TRM11Q12463 JHD1YER051W 1479 nt8.57□□□□□ -1.04
TRM11Q12463 PUP2YGR253C 783 nt8.57□□□□□ -1.04
TRM11Q12463 TIM50YPL063W 1431 nt8.55□□□□□ -1.04
TRM11Q12463 TRP2YER090W 1524 nt8.55□□□□□ -1.04
TRM11Q12463 CPT1YNL130C 1182 nt8.55□□□□□ -1.04
TRM11Q12463 HBS1YKR084C 1836 nt8.54□□□□□ -1.04
TRM11Q12463 PRE10YOR362C 867 nt8.54□□□□□ -1.04
TRM11Q12463 MTO1YGL236C 2010 nt8.53□□□□□ -1.04
TRM11Q12463 PNS1YOR161C 1620 nt8.53□□□□□ -1.04
TRM11Q12463 SPR1YOR190W 1338 nt8.53□□□□□ -1.04
TRM11Q12463 HXT11YOL156W 1704 nt8.52□□□□□ -1.05
TRM11Q12463 DUR3YHL016C 2208 nt8.52□□□□□ -1.05
TRM11Q12463 YJL009WYJL009W 327 nt8.52□□□□□ -1.05
TRM11Q12463 THI6YPL214C 1623 nt8.51□□□□□ -1.05
TRM11Q12463 YMC2YBR104W 990 nt8.51□□□□□ -1.05
TRM11Q12463 URA1YKL216W 945 nt8.5□□□□□ -1.05
TRM11Q12463 MRS4YKR052C 915 nt8.5□□□□□ -1.05
TRM11Q12463 YBR056WYBR056W 1506 nt8.49□□□□□ -1.05
TRM11Q12463 NCA3YJL116C 1014 nt8.49□□□□□ -1.05
TRM11Q12463 MEP1YGR121C 1479 nt8.49□□□□□ -1.05
TRM11Q12463 ESBP6YNL125C 2022 nt8.47□□□□□ -1.05
TRM11Q12463 SRM1YGL097W 1449 nt8.47□□□□□ -1.05
TRM11Q12463 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt8.47□□□□□ -1.05
TRM11Q12463 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt8.47□□□□□ -1.05
TRM11Q12463 PIH1YHR034C 1035 nt8.47□□□□□ -1.05
TRM11Q12463 LAT1YNL071W 1449 nt8.46□□□□□ -1.05
TRM11Q12463 DOC1YGL240W 753 nt8.46□□□□□ -1.06
TRM11Q12463 APT1YML022W 564 nt8.46□□□□□ -1.06
TRM11Q12463 Q0010Q0010 387 nt8.46□□□□□ -1.06
TRM11Q12463 AAT1YKL106W 1356 nt8.46□□□□□ -1.06
TRM11Q12463 HXT8YJL214W 1710 nt8.46□□□□□ -1.06
TRM11Q12463 SLM3YDL033C 1254 nt8.45□□□□□ -1.06
TRM11Q12463 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt8.45□□□□□ -1.06
TRM11Q12463 YRF1-2YER190W 5046 nt8.44□□□□□ -1.06
TRM11Q12463 DUS3YLR401C 2007 nt8.44□□□□□ -1.06
TRM11Q12463 TPN1YGL186C 1740 nt8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.1 ms