Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc162pQ0VG85 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc162pQ0VG85 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc162pQ0VG85 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc162pQ0VG85 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc162pQ0VG85 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc162pQ0VG85 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc162pQ0VG85 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc162pQ0VG85 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc162pQ0VG85 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc162pQ0VG85 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc162pQ0VG85 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc162pQ0VG85 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc162pQ0VG85 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc162pQ0VG85 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc162pQ0VG85 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc162pQ0VG85 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc162pQ0VG85 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc162pQ0VG85 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc162pQ0VG85 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc162pQ0VG85 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc162pQ0VG85 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc162pQ0VG85 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc162pQ0VG85 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc162pQ0VG85 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc162pQ0VG85 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc162pQ0VG85 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc162pQ0VG85 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc162pQ0VG85 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc162pQ0VG85 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc162pQ0VG85 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc162pQ0VG85 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc162pQ0VG85 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc162pQ0VG85 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc162pQ0VG85 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc162pQ0VG85 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc162pQ0VG85 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc162pQ0VG85 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc162pQ0VG85 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc162pQ0VG85 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc162pQ0VG85 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc162pQ0VG85 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc162pQ0VG85 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc162pQ0VG85 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc162pQ0VG85 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc162pQ0VG85 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc162pQ0VG85 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc162pQ0VG85 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc162pQ0VG85 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc162pQ0VG85 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc162pQ0VG85 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc162pQ0VG85 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc162pQ0VG85 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc162pQ0VG85 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc162pQ0VG85 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc162pQ0VG85 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc162pQ0VG85 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc162pQ0VG85 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc162pQ0VG85 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc162pQ0VG85 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc162pQ0VG85 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc162pQ0VG85 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc162pQ0VG85 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc162pQ0VG85 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc162pQ0VG85 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc162pQ0VG85 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc162pQ0VG85 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc162pQ0VG85 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc162pQ0VG85 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc162pQ0VG85 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc162pQ0VG85 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc162pQ0VG85 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc162pQ0VG85 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc162pQ0VG85 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc162pQ0VG85 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc162pQ0VG85 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms